>デザインテンプレートフォルダのトップディレクトリ
>これは/wp-content/themes/の事でしょうか？
WordPressを新規インストールした状態ですと、themesフォルダ内に classic と default がデザインテンプレートとして
あると思います。
仮に classic をウェブサイトのデザインで利用するのであれば、classicフォルダ内に 、「cover.swf」、「quickcart.js」、「quickcart.swf」、「quickorder.swf」、「quickvriation.swf」ファイルを置いて下さい。

>１、デザインテンプレートPHPファイルに追加
>たとえばsidebar.phpの事でしょうか？
（１）のスクリプト記述は header.php ファイル内の ＜head＞から＜／head＞の間に記述して下さい。
上の方は titleやmeta関係が記述されていますので、＜／head＞のすぐ上あたりで良いかと思います。

以上ですが、その他分かり難い箇所がありましたらご質問下さい。

>デザインテンプレートフォルダのトップディレクトリ
これは/wp-content/themes/の事でしょうか？

あと
>１、デザインテンプレートPHPファイルに追加
たとえばsidebar.phpの事でしょうか？

不躾なご質問とは承知しておりますが
何卒、ご理解いただきご教示いただけませんでしょうか？

どうぞよろしくお願い申し上げます